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2007
年在《自然遺傳學評論》
(
Nature Reviews of Genetics
)
名為
“
全基因組
的轉錄和基因組結構的影響
”
的論文中,對這些不編碼蛋白質的
DNA
的神秘的廣泛複
雜功能和重要性質作如下的解釋
:
證據表明,大多數的人類基因組
DNA
的兩條鏈都可能被轉錄,這意味著基因組
的轉錄單位和調節元件的大量重疊。
這些觀察結果表明,基因組結構不是只有一
個功能的,而是代替交織和模塊化,並且該相同的基因組序列具有多項功能:即用
作多個獨立調節的轉錄物和作為調節區。
(
註
26)
同樣地,一篇《科學》
(Science)
雜誌
2008
年的報告發現
,
幾乎所有被詳細
研究的真核細胞基因組都被轉錄
,
產生巨量不製造蛋白質的
RNA,
其中很有可能是
有功能的:
科學在過去的幾年中已經表明
,
所有被研究的真核細胞的基因組幾乎都完全
被轉錄,產生巨量的非製造蛋白質的
RNA
(非編碼
RNA
)。
與此同時,人們越來越
明顯了解,許多這些
RNA
都有調控功能。
在這裡我們強調最新的研究進展,說明非
編碼
RNA
控制的基因組動態,細胞生物學和多樣性的發展模範。
(
註
27)
這報告接著具體地闡述
重複
元素如何發揮著細胞控制中的功能
:
“
由於大量的
重複序列被轉錄,這可能代表整個基因組控制染色質結構的策略
,
並可能被保守貫
穿真核生物界
”
。
(
註
28)
在
2003
年的一篇《科學》雜誌一篇文章中作者承認
,
類似柯林斯所使用的
“
垃
圾
DNA
”
的標籤
,
實在阻礙了科學家尋索非編碼重複元素的功能:
雖然朗朗上口,術語
“
垃圾
DNA
”
多年來攔阻了主流的科硏人員研究非編碼
DNA
,除了一小部分的基因組的
“
流浪漢
”
(clochard)
以外
,
誰想在基因組的垃圾堆
中撿破爛?然而像平時一樣
,
在科學界也有一些
“
流浪漢
”
冒被嘲笑的危險
,
去探
索不受歡迎的領域。因為他們的努力
,
人們對垃圾
DNA
的看法
,
特別是重複元素,
於
20
世紀
90
年代初開始改變。
現在,越來越多的生物學家把重複元件當作為基因
組的寶庫。
(
註
29)
儘管與普遍達爾文的假設相反,這
文章
得出的結論是
,
“
重複元件不是無用的
垃圾
DNA,
而是真核基因組的重要組成部分。
”
(
註
30)
除了重複元素,另一種柯林斯所引用的
“
垃圾
DNA
”
來支持猿
/
人共同的祖先是
“
假基因
”
(pseudogene)
。
柯林斯在
《上帝的語言》
中寫道,人類有一個假基因(胱天蛋白酶
caspase-
12
)是無功能的,他問道
:
“
為什麼上帝要煩勞在這個精確的位置插入這樣無功能
的基因呢
?
”
(
註
31)
。
他在他後來的書《
科學與信仰的語言》
(
2011
年)引用同