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同样地,一篇《科学》
(Science)
杂志
2008
年的报告发现
,
几乎所有被详
细研究的真核细胞基因组都被转录
,
产生巨量不制造蛋白质的
RNA,
其中很有可
能是有功能的:
科学在过去的几年中已经表明
,
所有被研究的真核细胞的基因组几乎都完
全被转录,产生巨量的非制造蛋白质的
RNA
(非编码
RNA
)。
与此同时,人们
越来越明显了解,许多这些
RNA
都有调控功能。
在这里我们强调最新的研究进
展,说明非编码
RNA
控制的基因组动态,细胞生物学和多样性的发展模范。
(
注
27)
这报告接着具体地阐述
重复
元素如何发挥着细胞控制中的功能
:
“
由于大量
的重复序列被转录,这可能代表整个基因组控制染色质结构的策略
,
并可能被
保守贯穿真核生物界
”
。
(
注
28)
在
2003
年的一篇《科学》杂志一篇文章中作者承认
,
类似柯林斯所使用的
“
垃圾
DNA
”
的标签
,
实在阻碍了科学家寻索非编码重复元素的功能:
虽然朗朗上口,术语
“
垃圾
DNA
”
多年来拦阻了主流的科硏人员研究非编码
DNA
,除了一小部分的基因组的
“
流浪汉
”
(clochard)
以外
,
谁想在基因组的垃
圾堆中捡破烂?然而像平时一样
,
在科学界也有一些
“
流浪汉
”
冒被嘲笑的危
险
,
去探索不受欢迎的领域。因为他们的努力
,
人们对垃圾
DNA
的看法
,
特别
是重复元素,于
20
世纪
90
年代初开始改变。
现在,越来越多的生物学家把重复
元件当作为基因组的宝库。
(
注
29)
尽管与普遍达尔文的假设相反,这
文章
得出的结论是
,
“
重复元件不是无用
的垃圾
DNA,
而是真核基因组的重要组成部分。
”
(
注
30)
除了重复元素,另一种柯林斯所引用的
“
垃圾
DNA
”
来支持猿
/
人共同的祖先
是
“
假基因
”
(pseudogene)
。
柯林斯在
《上帝的语言》
中写道,人类有一个假基因(胱天蛋白酶
caspase-12
)是无功能的,他问道
:
“
为什么上帝要烦劳在这个精确的位置插入
这样无功能的基因呢
?
”
(
注
31)
。
他在他后来的书《
科学与信仰的语言》
(
2011
年)引用同样的数据
,
所谓无功能的维生素
C
假基因。
他说
,
“
宣称人类
基因组是由上帝的独立创造,而不是从一个共同的祖先进化而来,意味着神在
我们的基因组中插入一个破碎的
DNA
片段
,
这是无稽之谈。
”
(
注
32)
同样
,
布朗大
学的生物学家肯尼思
.
米勒援引这等假基因作为
“
压倒性
”
的证据
,
因为
“
共同的
祖先
,
是唯一在同一个基因中有那么多的匹配误差的可能解释。
”
(
注
33)
但假
基因
真的
是
无功能的破碎的
DNA
吗
?
像
AREs
一样,假基因的多种功能已经被发现了。
(
注
34)
事实上,两个权
威生物学家在《遗传学年度评论》
(Annual Review of Genetics)
写道
,
“
已经